Основні напрями наукових розробок інституту:
науковий аналіз і прогнозування стану здоров'я населення України та факторів, що на нього впливають;
аналіз медико-демографічних показників відтворення населення та створення на його основі атласу картограмта типологізації територій України;
дослідження закономірностей розвитку системи профілактики хвороб і формування здорового способу життя;
моніторинг виконання політики ВООЗ "Здоров'я для всіх на XXI століття" в Україні;
наукове обґрунтування та розробка питань організації та управління охороною здоров'я, формування та супроводження державних галузевих програм розвитку охорони здоров'я;
впровадження сімейної медицини в охорону здоров'я, реструктуризація медичної допомоги;
наукова розробка проблем стандартизації охорони здоров'я, обґрунтування та створення стандартів медичних технологій, державних соціальних стандартів в охороні здоров'я;
наукове обґрунтування і розробка методики комплексної рейтингової оцінки діяльності та ресурсного забезпечення охорони здоров'я, визначення рейтингів адміністративних територій;
вдосконалення організаційно-правового забезпечення державного санепіднагляду, обґрунтування комплексної оцінки діяльності СЕС;
вивчення медичних наслідків аварії на ЧАЕС, забезпече